MATLAB实现基因表达谱的复杂网络研究 毕业论文+源码

题 目	基因表达谱的复杂网络研究
摘	要：
本文采用复杂网络理论，整合基因关联信息和文献中的结果，得到一些关于结肠癌标志基因的可能的结果。首先利用分类信息指数对数据进行初步筛选，选出了 314 个基因。对选出的基因分别做肿瘤样本和正常样本的相关系数矩阵，利用 Kruskal 算法分别对两个相关系数矩阵做最小生成树，然后通过两种方法比较选出阈值，建立起节点间的连边关系，得到致病前后的两个网络。根据复杂网络中的相关理论，分别对肿瘤样本和正常样本进行社区划分，最后通过观察两个样本的网络系统，分析致病前后基因的变化情况，建议了结肠癌的特征基因。
关键字：相关系数矩阵 最小生成树 复杂网络 社区结构



目录
― 问题的重述	
二 问题分析	
3.1 基因表达谱	
三 数据	
3.2 文献中发现的结肠癌相关基因	
四 方法	
4.1 距离矩阵	
= 1 -	
4.3 基因关系网络	
4.3.1 阈值的选取	
4.3.2 网络的生成	
4.4 社区的划分	
5.1 度序列变化	
5.2 网络比较	
5.3 网络中的几个特殊节点	
六 结论